在我国的农村地区，土地确权是一项至关重要的工作，在确权过程中，由于各种原因，纠纷时有发生，为了更好地保障农民的合法权益，以下将详细介绍土地确权纠纷的处理流程。

一、土地确权争议的处理原则与方法

土地确权争议的处理，首先要遵循土地确权的基本原则和方法，就是要确定实践中具体土地权利的类型、性质、主体、客体，以及权利内容等，这需要我们深入理解现行法律法规和规章中规定的处理方式、处理机关、处理程序。

二、已经确权的土地纠纷处理方法

1、协商解决：在土地确权后，若出现纠纷，首先应尝试由双方当事人进行协商，协商是解决纠纷的首选方式，有助于双方在平等、自愿的基础上达成共识。

2、人民政府处理：若协商不成，当事人可以向人民政府申请处理，人民政府将依法进行调查，并作出相应的处理决定。

3、行政诉讼：对于当事人对人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，以作出处理决定的人民政府为被告提起行政诉讼。

三、农村土地确权纠纷处理流程

1、提出申请：当农村土地确权出现纠纷时，涉及的双方需向县级以上人民政府土地管理部门或乡级人民政府提出书面申请，明确指出纠纷的具体内容和要求。

2、人民政府调查：接到申请后，人民政府将组织相关人员对纠纷进行现场调查，收集相关证据。

3、调解处理：在调查的基础上，人民政府将组织双方当事人进行调解，并作出书面调解书。

4、裁决处理：若调解不成，人民政府将根据调查结果和相关法律法规，作出裁决。

四、农村土地确权登记纠纷的解决

1、法律分析：土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决，协商不成的，由人民政府处理，单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。

2、证据收集：在纠纷处理过程中，受害者应收集户口簿、身份证等相关证据，以证明自己的合法身份和应享有的土地权益。

3、确权目的：确权的目的是明晰产权，防止因为登记制度的不完善导致的土地权属纠纷，下一步的方向可能是推广农村集体承包经营权和宅基地使用权的流转。

五、土地确权发生纠纷的处理

1、协商解决：由当事人协商解决，所谓协商解决是指土地纠纷发生以后，由当事人在自愿、互谅的基础上，按照有关法律规定，在不损害他人利益的前提下，直接进行磋商，自行解决纠纷的办法。

2、人民政府处理：协商不成的，由人民政府处理。

3、行政诉讼：当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

六、已经确权的土地有纠纷怎么办

1、提出申请：向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请。

2、出示证据：双方当事人出示举证的材料和依据。

3、调查取证：工作人员现场调查取证。

4、调解处理：组织双方当事人进行调解，并作出书面调解书。

5、裁决处理：调解未达成协议的或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府错处处理决定。

土地确权纠纷的处理是一个复杂的过程，需要各方共同努力，通过以上流程，我们可以更好地维护农民的合法权益，促进农村社会的和谐稳定。